可能です。
巡回対象ドメイン(任意)から、巡回が必要なドメイン(例:ID連携など)を追加してください。
巡回対象ドメインに対してはスキャンの実施はしません。
スキャン一覧 > スキャン新規作成 > サイト・スキャン基本情報 > スキャン基本オプション > 巡回対象ドメイン(任意)から行ってください。